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已收藏单纯蛋白质缺乏虽然也可发生，但多合并其他营养不良。蛋白质缺乏可表现为淡漠、无欲状、水肿、皮肤变薄及色素变化。其口腔表现为舌质水肿、舌侧缘有扇形齿压迹，舌乳头萎缩、舌背面发红及平滑；唇炎及唇裂隙，唇周围有色素沉着；可有流涎及口腔干燥，口腔易受创伤及感染。
脂肪酸为前列腺合成的要素，影响炎症反应，调整某些代谢作用及环磷酸腺苷的合成。必需脂肪酸的缺乏，会影响试验动物的牙齿生成，但未证实也可发生于人类。
全身皮肤可表现角化过度及干眼病；口腔黏膜也可出现角化过度及白斑；唾液腺导管上皮化生可发生口干及影响味觉与嗅觉。动物试验有牙釉质发育不全，但人类未能证实。
可有牙龈出血，自发性或于刷牙后，另外可有拔牙后出血不止现象。
动物试验有牙齿及牙周的微小变化，但在人类未证实。
可有末梢神经炎及心肌损害，口腔表现没有肯定的证实。
可有脂溢性皮炎与角膜血管翳，也可发生贫血（与叶酸代谢失调有关）；也可有口腔表现与叶酸缺乏表现相似，可有唇裂隙、口角炎，也可继发感染，舌炎，地图状舌、口腔溃疡、口腔不适感及流涎。
可有神经系统表现，如惊厥、抽搐；血液系统表现可有小细胞性缺铁性贫血；皮肤表现为皮炎，但多与其他B族维生素缺乏并存，如烟酸缺乏。维生素B6缺乏可见于长期服用异烟肼患者。口腔表现为口唇周围皮炎，皮肤充血脱屑，也见于眼鼻周围。
维生素B12缺乏可有舌炎及口腔炎，舌炎占维生素B12缺乏的恶性贫血患者的50%～60%。舌开始有水肿及触疼，影响进食，以后可发生进行性线样萎缩。也可有复发性口腔溃疡；口腔表现可先于贫血出现，此时口腔表现为维生素B12缺乏的唯一症状，若能及时确诊并应用维生素B12治疗，病情很快缓解，于48小时内即可恢复。
症状与维生素B12缺乏类似，且多与其并存。叶酸缺乏影响了DNA的合成，使口腔黏膜上皮再生受到干扰而易致口腔溃疡形成。临床上易发生于化疗时抗叶酸药物的应用，如甲氨蝶呤。
缺乏全身表现为坏血病，口腔表现为牙龈出血，可为首发症状，牙龈肿胀，边缘可糜烂及形成溃疡，牙槽骨也可萎缩，牙齿脱落。
