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已收藏衣原体属分为沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis，CT）、肺炎衣原体（Chlamydia pneumoniae，CP）、鹦鹉热衣原体（Chlamydia psittaei）和家畜衣原体（Chlamydia pecorum）4种。衣原体既不同于细菌也不同于病毒，是一类能通过细菌滤器、严格真核细胞内寄生、有独特发育周期的原核细胞型微生物，但同时具有细菌和病毒的特点，与细菌相似处为其具有细胞壁，相同的繁殖分裂方式，有DNA和RNA；与病毒相似处为只在细胞内生长。常见的引起肺炎的衣原体为CP和CT。
血清学证实，在世界范围内有40%~90%的人群中CP抗体阳性，发展中国家的CP感染率约60%。CP多见于学龄期和青少年，居感染性肺炎的第三或第四位，其感染率与人口密度呈正相关，儿童感染率在20%左右。CT多感染6个月尤其是＜3个月的婴儿，是新生儿肺炎常见的原因，孕妇是最直接的感染源，多由感染的母亲垂直传染或眼部感染经鼻泪管进入呼吸道，目前CT在全球性传播疾病中居首位，孕妇宫颈CT阳性率为2%~47%，其所生婴儿20%~50%发生结膜炎，10%~20%可发生肺炎。3／4婴儿无热肺炎为CT所致，多见于6个月内的婴儿。新生儿肺炎鼻咽拭子培养CT阳性率高达22.9%（25／109）。衣原体肺炎也可合并其他病原感染，如肺炎链球菌、肺炎支原体和呼吸道合胞病毒感染。有文献报道，肺炎衣原体在急性下呼吸道感染中可导致支气管痉挛，而发生喘息。
X线检查：CT肺炎可见弥漫性间质性病变及斑片状肺浸润伴肺气肿；CP肺炎多为单侧下叶浸润，表现为节段性肺炎，也可为广泛单侧或双侧病灶，重症可伴发胸腔积液。肺部体征和X线所见往往经过1个多月才消失。
大环内酯类抗生素为首选。婴儿选用红霉素口服，共2周，如有效可再延长1~2周。或用罗红霉素、阿奇霉素、克拉霉素，疗程约2~3周，可使病程缩短。在2021年美国疾病预防控制中心性传播感染治疗指南-衣原体感染“Sexually Transmitted Infections Treatment Guidelines，2021-Chlamydial Infection”中指出，对于年龄≥8岁儿童，也可选用多西环素100mg，口服，2次／d，共7日，青霉素族及氨基糖苷类均无疗效。美国指南中，儿童CT感染必须在治疗2周后通过培养法确定疗效。本病预后良好，部分儿童随访7~8年后仍有呼吸道症状如咳、喘和肺功能异常。
因肺炎衣原体可能通过呼吸道传播，故其预防方法同普通呼吸道感染疾病。对于沙眼衣原体肺炎，应在妊娠期诊治，用阿奇霉素第1日1g，以后2日每日0.5g。替代方案：红霉素碱0.5g，4次／d，共10~14日。妊娠期忌用四环素类及喹诺酮类。红霉素每日2g的疗法治愈率84%~94%，但半数以上患者出现严重胃肠道不良反应，不能完成治疗；红霉素每日1g的疗法较能耐受，但疗效差。阿奇霉素可作为妊娠期沙眼衣原体感染的治疗药物，临床资料显示其安全、有效。妊娠期感染治疗后建议做判愈试验，即疗程结束后2周做抗原检测试验，4周做核酸扩增试验。在行判愈试验后3个月和妊娠后3个月还应重复做生殖道沙眼衣原体检测，以减少或避免胎儿或新生儿感染。
